Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxc5P32043 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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