Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctnnd1P30999 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ctnnd1P30999 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms