Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccnd3P30282 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms