Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RxrbP28704 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RxrbP28704 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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