Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Defa5P28312 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Defa5P28312 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms