Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gjb3P28231 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb3P28231 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms