Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gjb1P28230 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms