Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Psmb9P28076 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms