Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vav1P27870 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms