Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms