Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctnna1P26231 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms