Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk11bP24788 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdk11bP24788 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms