Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd8P23463 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hoxd8P23463 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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