Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcer1aP20489 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fcer1aP20489 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fcer1aP20489 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fcer1aP20489 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fcer1aP20489 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Fcer1aP20489 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Fcer1aP20489 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Fcer1aP20489 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Fcer1aP20489 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Fcer1aP20489 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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