Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrkcaP20444 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkcaP20444 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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