Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpl13aP19253 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms