Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RargP18911 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RargP18911 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RargP18911 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RargP18911 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms