Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka1P18653 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms