Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gata1P17679 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms