Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp53P15975 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms