Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim30aP15533 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim30aP15533 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms