Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
OtcP11725 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
OtcP11725 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
OtcP11725 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
OtcP11725 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
OtcP11725 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OtcP11725 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OtcP11725 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms