Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P10404 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P10404 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
P10404 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
P10404 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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