Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PolP10400 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PolP10400 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PolP10400 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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