Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Myod1P10085 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Myod1P10085 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms