Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Schip1P0DPB4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms