Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Surf1P09925 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Surf1P09925 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms