Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxd3P09027 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxd3P09027 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms