Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Col4a2P08122 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms