Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
GzmbP04187 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
GzmbP04187 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms