Protein–RNA interactions for Protein: P01738

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01738 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01738 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01738 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01738 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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