Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01648 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01648 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01648 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P01648 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P01648 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
P01648 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01648 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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