Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CopeO89079 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CopeO89079 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CopeO89079 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CopeO89079 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CopeO89079 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CopeO89079 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CopeO89079 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CopeO89079 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CopeO89079 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CopeO89079 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CopeO89079 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms