Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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CcnkO88874 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CcnkO88874 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CcnkO88874 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CcnkO88874 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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CcnkO88874 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CcnkO88874 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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