Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc6a20bO88575 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20bO88575 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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