Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp4O70480 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp4O70480 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms