Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Copb2O55029 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Copb2O55029 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms