Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BckdkO55028 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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BckdkO55028 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BckdkO55028 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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