Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trappc3O55013 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc3O55013 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms