Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prom1O54990 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms