Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rdh16O54909 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rdh16O54909 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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