Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl25O35903 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl25O35903 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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