Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Cited2O35740 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Cited2O35740 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Cited2O35740 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cited2O35740 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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