Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RaxO35602 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RaxO35602 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RaxO35602 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RaxO35602 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RaxO35602 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RaxO35602 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RaxO35602 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RaxO35602 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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