Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Opn1mwO35599 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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