Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Prrt1O35449 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt1O35449 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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