Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Kcns1O35173 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Kcns1O35173 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcns1O35173 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Kcns1O35173 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Kcns1O35173 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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