Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pitx3O35160 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pitx3O35160 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms