Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn4O35054 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn4O35054 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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