Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casq2O09161 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casq2O09161 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casq2O09161 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casq2O09161 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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